tai64n
daemontools付属のtai64nを使うと、標準入力の各行に現在の時刻を付与できます。
$ cat ./test.txt | tai64n @400000004af418f312d2bbb4 aa @400000004af418f312d2c76c bb @400000004af418f312d2cf3c cc
形式が特殊なので意味不明ですが、tai64nlocal を使うと分かりやすい形に変換して表示できます。tai64nlocal もdaemontools付属のプログラムです。
$ cat ./test.txt | tai64n | tai64nlocal 2009-11-06 21:39:30.892006500 aa 2009-11-06 21:39:30.892009500 bb 2009-11-06 21:39:30.892011500 cc